Galvenā atšķirība: Atomi ir pamatvienības, no kurām visas ir izgatavotas. Atomi ir niecīgi, sākot no 0, 1 līdz 0, 5 nanometriem. Katra elementa atoms sastāv no protoniem, neitroniem un elektroniem. Dažādu elementu atomi kopā veido molekulas. Tas notiek, izmantojot ķīmisku reakciju. Molekula ir mazākais ķīmiskās vielas daudzums, kas var pastāvēt.
Elements ir tīra ķīmiskā viela, kurai ir viens vai viens atoma veids, kas atšķiras ar atomu skaitu. Atomu skaits ir iegūts no to elementu skaita, kas atrodas elementa kodolā. Kopumā ir identificēti 118 elementi, kas ir sadalīti starp metālu, metālu un nemetāliem. Katram elementam ir savs īpašību kopums. Lielākā daļa elementu ir pieejami uz zemes, bet daži ir izstrādāti mākslīgi, izmantojot kodolreakcijas. Elements jau ir neapstrādātākā formā, un to vairs nevar sadalīt. Visi elementi ir atrodami periodiskajā tabulā, kas uzskaitīta pēc atoma numura.
Katra elementa atoms sastāv no protoniem, neitroniem un elektroniem. Protoni un neitroni veido atoma kodolu un atrodas atoma vidū. Kodolu ieskauj elektronu mākonis, kas ir piesaistīts kodolam ar elektromagnētisko spēku. Elektroniem ir negatīvs lādiņš, kā tas ir piesaistīts kodolam, jo kodolā esošajiem protoniem ir pozitīva lādiņa. Neitroniem, no otras puses, nav maksas.
Protonu, neitronu un elektronu skaits atomā nosaka, kurš elements tas ir. Piemēram: dzelzs atoms satur 26 protonus, 30 neitronus un 26 elektronus. Katram dzelzs atomam būs šī konfigurācija.
Dažādu elementu atomi kopā veido molekulas. Tas notiek, izmantojot ķīmisku reakciju. Piemēram: divi ūdeņraža atomi un viens skābekļa atoms apvienojas, veidojot ūdens molekulu.
Molekulai var būt ļoti atšķirīgas īpašības, salīdzinot ar elementiem, ko tā izgatavo. Piemēram: ūdens darbojas ļoti atšķirīgi nekā skābeklis vai ūdeņradis, kaut arī tas sastāv no diviem ūdeņraža atomiem un viena skābekļa atoma.
Turklāt atoms nevar pastāvīgi pastāvēt dabā, nesaistoties ar kaut ko. Mēs nekad neatradīsim tikai vienu skābekļa atomu vai vienu oglekļa atomu. Tas vienmēr ir saistīts ar kaut ko, piemēram, O2 (skābekli) vai CO2 (oglekļa dioksīdu). Molekulā saista molekula var pastāvēt neatkarīgi no dabas, tāpēc mēs vienmēr varam atrast skābekļa molekulu, oglekļa dioksīda molekulu, ūdens molekulu (H2O) utt.
Molekulā atomi ir pievienoti noteiktā formā vai formā. Tas galvenokārt ir atkarīgs no to obligāciju skaita, kuras atoms var radīt. Atomi veido molekulas, veidojot ķīmiskās saites. Skābekļa atomiem vienmēr ir divas saites ar citiem atomiem, oglekļa atomiem vienmēr ir četras saites ar citiem atomiem, un slāpekļa atomiem vienmēr ir trīs saites ar citiem atomiem. Šī iemesla dēļ konkrētam molekulas veidam vienmēr ir īpaša forma, piemēram, piecstūra, sešstūra, sānu, divpusēja utt.
Molekulas vienmēr mēdz apvienoties, veidojoties atkarībā no to stāvokļa. Piemēram, gāzveida stāvoklī molekulas mēdz būt tikai lidojošas. Šķidrā stāvoklī molekulas mēdz būt brīvi sagrupētas kopā, lai tās joprojām varētu pārvietoties. Tā kā cietā stāvoklī molekulas ir cieši iepakotas un var vibrēt.
Molekulas parasti ir molekulāras formulas. Piemēram: O2, H2O, CO2, C6H12O6 (cukurs). Molekulārā formula ir elementa nosaukums, kam seko šī elementa atomu skaits molekulā.