Galvenā atšķirība: viss alus pieder pie divām galvenajām kategorijām: ales un lager. Lagers ir grunts raudzēšanas alus veids. Pilsner ir lager, kas radies Plzeņā (Pilsen), pilsētā, kas atrodas Bohēmijā.
Galvenā atšķirība starp ales un lager ir veids, kādā tās tiek fermentētas. Ales fermentē, izmantojot raudzēšanas raugus. Raugs tiek nosaukts kā tāds, jo tas mēdz savākties alus alus virsmā, jo tas fermentējas. Alternatīvi lager tiek fermentēts, izmantojot grunts raudzēšanas raugu, ti, rauga veidu, kas nepaliek virsmā. Vēl viena atšķirība starp abām ir temperatūra, ko tās fermentē. Atkritumus fermentē aukstā temperatūrā visā procesā; tā kā ales fermentē siltākā temperatūrā. Kad ale ir fermentēta, tā ir atdzesēta, kas aptur fermentācijas procesu. No otras puses, Lager turpina fermentēt pēc saldēšanas.
Ievērojot to definīcijas, var atzīmēt, ka lager ir alus veids. Pilsner, no otras puses, ir īpašs alus veids; kas ir oficiāli klasificēts kā lager. Pilsner ir lager veids; konkrēti tas ir bāla lager veida. Gaišākā lager un pilsner visvairāk identificējošā iezīme ir tās krāsa. Tam ir ļoti bāla līdz zelta krāsai; parasti krāsa, ko vairums cilvēku saista ar alu.