Galvenā atšķirība: Galvenā atšķirība starp abām šūnām ir tāda, ka prokariotiskajām šūnām būtībā nav kodolu, bet eukariotiskajām šūnām ir patiesi kodoli. Eukariotiskās šūnas ir lielākas un sarežģītākas nekā prokariotiskās šūnas.

Visi dzīvie organismi var tikt sakārtoti vienā no divām grupām atkarībā no to šūnu pamata struktūras. Divas galvenās šūnu klases ir prokarioti un eukarioti. Šiem diviem šūnu veidiem ir daudz kopīga. Viņi veic tādas pašas funkcijas un tādā pašā veidā. Abas ir norobežotas ar plazmas membrānām, kas piepildītas ar citoplazmu, un tām ir nelielas struktūras, ko sauc par ribosomu. Abām ir DNS, kas satur arhivētos norādījumus par šūnas darbību. Tomēr ir dažas atšķirības starp abiem šūnu veidiem.

Termins prokariots ir iegūts no grieķu vārda “prokariots”, kas nozīmē pirms kodoliem. Prokarioti ir organismi, kas sastāv no šūnām, kurām nav šūnu kodola vai jebkādu membrānas pārklājumu. Tas nozīmē, ka viņiem nav kodola. Arī ģenētiskais materiāls, proti, DNS, prokariotos nav saistīts kodolā. Turklāt DNS ir mazāk strukturēta un atrodas vienā cilpā. Lielākā daļa prokariotu veido tikai viena šūna, un tos sauc par vienšūnu organismu. Ir arī dažas prokariotas, kas ir izgatavotas no šūnu kolekcijām un tiek sauktas par multi-šūnu organismiem. Prokarioti ir sadalīti divās grupās:

• Baktērijas
• Arhitektūra

Eukarioti ir organismi, kas sastāv no šūnām, kurām piemīt membrānas saistīts kodols, kā arī ar membrānu saistītu organelu. Termins eukariots ir iegūts no grieķu vārda “œeukaryoteâ”, kas nozīmē patiesus vai labus kodolus. Šajā šūnā ir visas dzīvības karaļvalstis, izņemot moneru. Šiem organismiem šūnās ir ģenētiskais materiāls. Eukariotu ģenētiskais materiāls atrodas šūnas kodolā. Šo organismu DNS ir strukturēts un sakārtots hromosomās. Arī DNS ir lineāra un saistīta ar proteīniem, veidojot hromatīnu. Eukariotiskie organismi var būt vairāku šūnu vai vienšūnu organismi. Visi dzīvnieki tiek uzskatīti par eukariotiem. Citi eukarioti ietver augus, sēnītes un protistus.

Prokariotu un eukariotisko šūnu izmēri un sarežģītība ir savstarpēji saistītas. Šīs šūnas atšķiras viena no otras. Tomēr tie ir acīmredzami vairāk līdzīgi, nekā tie atšķiras, un tie ir skaidri savstarpēji saistīti. Biologi uzskata, ka eukariotiskā šūna ir skaidri attīstīta no prokariotiskās šūnas.

Prokariotisko un eukariotisko šūnu salīdzinājums:

	Prokariotiskā šūna	Eukariotiskā šūna
Definīcija	Tie ir organismi, kas sastāv no šūnām, kurām nav šūnu kodola vai jebkādu membrānas pārklājumu.	Šie organismi sastāv no šūnām, kas satur membrānu saistītu kodolu, kā arī no membrānas saistītām organelēm.
Nucleus	Tam nav kodola.	Tam ir patiess kodols, ko ierobežo dubultā membrāna.
DNS izkārtojums	Tam ir apļveida cilpa.	Tas ir lineārs.
Izmērs	Mazas šūnas (<5 µm)	Lielas šūnas (<10 µm)
Šūna	Vienmērīgs	Galvenokārt vairāku šūnu
Šūnapvalki	Parasti klāt; ķīmiski sarežģīti	Ja tas ir dabiski, tas ir ķīmiski vienkāršs
Olbaltumvielas	Tā DNS nesatur olbaltumvielas.	Tā satur DNS proteīnus, lai veidotu hromatīnu.
Ribosome	Tā satur nelielas ribosomas.	Tā satur lielas ribosomas.
Citoplazma	Nav citoskeleta	Vienmēr lietojiet cytoskeletu
Šūnu dalīšanās	Šūnu dalīšanās notiek ar bināro dalīšanu	Šūnu dalīšanās notiek ar mitozi
Pavairošana	Reproducēšana vienmēr ir nepamatota	Reproducēšana ir neskaidra vai seksuāla
Metabolisma ceļi	Milzīgs vielmaiņas ceļu klāsts	Bieži vielmaiņas ceļi
Flagella	Sastāv no diviem proteīna blokiem	Tas ir sarežģīts raksturs un sastāv no vairākiem mikrotubuliem
Vairāku šūnu formas	Reti	Bieži ar plašu audu veidošanos
Mesosomas	Viņi veic golgi-ķermeņu un mitohondriju funkcijas un palīdz arī atdalīt hromosomas.	Nav klāt
Plazmas membrāna	Nav ogļhidrātu un nav sterīnu	Ir pieejami gan sterīni, gan ogļhidrāti
Glikokalikss	Pastāv kā kapsula vai gļotas slānis	Pastāv dažās šūnās, kurās nav šūnu sienas
Piemērs	Baktērijas un arhīvs	Dzīvnieku šūnas un augu šūnas